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转座子稳转细胞株构建

 瞬时转染是指携带外源DNA的质粒或其他载体在细胞内以非整合状态存在,只在一段时间内表达其携带的基因,常通过短暂的基因表达进行基因功能研究,普通载体骨架的质粒如pcDNA3.1、pUC57即可满足需求;稳定转染则需将外源基因整合到宿主细胞的基因组中,以实现长期稳定的基因表达稳转细胞系需借助基因编辑技术进行构建,主要包括以下2种技术:CRISPR/Cas9技术DNA转座子技术。

DNA转座子技术:在自然界中,DNA转座子系统包含转座酶,该酶负责识别并催化转座子在基因组中的移动,其编码序列两端具有末端反向重复序列(TRs)。转座酶可在TRs位点和基因组位点引入双链断裂,从而使整个转座子区域发生转位。对于基因编辑应用,可以将转座酶组分进行分离,一个辅助质粒:编码转座酶;一个转座子质粒:含优化的两端TRs,中间是被转座区域,可插入我们想转座到宿主基因组中的目的基因序列。常用的转座系统包括:PiggyBac、睡美人(Sleeping Beauty)和Tol2,其特点见下表。

转座系统 常用的转座酶 转座酶活性 装载能力 整合方式 整合位点偏好
PiggyBac PBase,hyPBase,PBX 最高    27kb 基因内整合 TTAA
睡美人 SB,SB100X 较高 2-8kb 随机整合 TA
Tol2 Tol2 11kb 基因内整合 无偏好
 


其中,PiggyBac是最受欢迎的转座子系统之一,可用于递送转基因、shRNA、重组抗体等。PiggyBac转座子在发现后经过了一系列优化和改造,优化后的转座酶(hyPBase)使转座效率进一步提高,具有剪切活性但是整合活性缺失,确保在移除整合的序列后,该位置不会再次被转座子重新插入,实现无痕剪切。此外,PiggyBac转座子的一个显著优势在于其大装载量,可以在5’和3’ TR之间携带长达27 kb的DNA。PiggyBac转座子介导基因整合时会在染色体TTAA位点切割DNA,并且优先选择基因内区域。

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